Als Verein wird die ZGF von einem Vorstand geführt. Die anwesenden Vollmitglieder wählen und entlastet den Vorstand bei der jährlichen Mitgliederversammlung. Der Vorstand besteht aus bis zu acht Personen und ist auf vier Jahre gewählt. Er beschließt über das vom Geschäftsführer vorgelegte Jahresprogramm, den Haushalt und die Vermögensverwaltung.
Alle Vorstandsmitglieder sind ehrenamtlich tätig. Der ZGF-Vorstand wiederum beruft die Mitglieder des Stiftungsrates unserer Förderstiftung „Hilfe für die bedrohte Tierwelt“.
Klaus Becker ist amtierender ZGF-Präsident. Er wurde am 22. September 2014 ins Amt gewählt und ist seit 2023 stellvertretender Vorsitzender des Stiftungsrates der Stiftung Hilfe für die bedrohte Tierwelt (seit 2010 Mitglied des Stiftungsrats). Klaus Becker ist seit Oktober 2023 Chairman Europe, Middle East, Africa and India der KPMG EMA Cooperative und Mitglied im Global Executive Committee und Global Board von KPMG International.
Professor Dr. Thomas Müller ist Mitglied im ZGF-Vorstand seit 2024. Er ist Biologe und arbeitet bei der Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung. Er ist Experte für die Bewegungsökologie von Wildtieren und den Biodiversitätsschutz und hat unter anderem auch über die Bewegungsmuster der Saiga-Antilopen geforscht, für deren Schutz sich die ZGF einsetzt. Darüber hinaus hat er am Aufbau der Frankfurt Conservation Center gGmbH seit ihrer Gründung mitgewirkt.
Hans Bernhardt ist Mitglied im ZGF-Vorstand seit 2020 und seit 2023 Vorsitzender des Stiftungsrats der Stiftung Hilfe für die bedrohte Tierwelt (Mitglied seit 2016, stellvertretender Vorsitzender von 2018-2022). Er war Teil des Vorstands der Landwirtschaftlichen Rentenbank.
Gabriele Eick ist Mitglied im ZGF-Vorstand seit 2024. Seit 2018 war Sie bereits Teil des Stiftungsrates. Sie ist Vorstandsvorsitzende der Bruno H. Schubert-Stiftung und zudem Aufsichtsratsvorsitzende der Aramark GmbH und in zwei Aufsichtsräten der Gothaer Versicherungen.